O período de férias, sobretudo no verão, é comum o aumento de acidentes aquáticos e afogamentos no Rio São Francisco. Por isso, a Marinha do Brasil e o Corpo de Bombeiros intensificaram as fiscalizações ao longo do rio em Petrolina (PE) e Juazeiro (BA), para evitar fatos dessa natureza.
Os banhistas são orientados sobre os perigos de mergulhar sozinhos ou de nadar até áreas mais profundas. Os profissionais advertem ainda para os problemas que podem ser ocasionados por quem ingere bebida alcoólica, ou muita comida, antes de entrar no rio.
Os frequentadores das ilhas também devem ficar atentos. Quem leva crianças para esses locais deve redobrar os cuidados. O alerta vale ainda para quem utiliza algum tipo de embarcação, caiaques ou stand up paddle. O uso de colete salva-vidas é fundamental, segundo as autoridades.